化学除磷药剂有三类，分别是石灰，铝盐和铁盐等。由于石灰对生物处理的pH影响较大，加之容易引起管道堵塞问题，所以以生物除磷为主的污水厂很少使用。国内较常用的是铁盐或铝盐即聚合硫酸铁与聚合氯化铝。城镇污水处理厂常用的除磷药剂为聚合硫酸铁。
    除磷药剂的投加位置有以下三种：
    1、预沉淀除磷：在初沉池前投加化学药剂，通过排除初沉池的污泥达到除磷的目的｡但是这种方法会大量增加污泥产量，并且对后续反硝化反应造成影响，一般不推荐使用。
    2、同步沉淀除磷：在生化反应池中投加化学药剂，通过排除二沉池的剩余污泥除磷｡ 同步沉淀除磷一般是在生化反应池曝气区尾部投加除磷药剂，结合生物除磷过程，将绝大部分的磷在生物处理段内予以去除｡这种方法除磷效率高，节省投药量，而且可以改善活性污泥在二沉池中的沉降性能，提高回流污泥浓度｡
    3、后沉淀除磷：即在二沉池后投加化学药剂，通过混合､絮凝及分离设施将残余在出水中的磷去除｡
    后沉淀除磷一般须设混凝反应池及终沉池，投资大，运行费用高。综上，辅助化学除磷的最佳投药位置宜设在生化反应池曝气区尾部｡同时，预留二沉池后除磷药剂投加点，以备应急情况下投入使用，确保最终出水。